基于Sentinel-2的闪电河流域农作物分类研究
Sentinel-2 Study on Crop Mapping of Shandian River Basin based on Images
通讯作者:
收稿日期: 2020-06-22 修回日期: 2021-04-04 网络出版日期: 2021-05-24
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Received: 2020-06-22 Revised: 2021-04-04 Online: 2021-05-24
作者简介 About authors
尹燕旻(1994-),女,山东泰安人,硕士研究生,主要从事农作物分类研究E⁃mail:
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尹燕旻, 贾立.
Yin Yanmin, Jia Li.
1 引 言
农业是国民经济的基础,是国家长治久安、百姓安居乐业的保障。农作物分布信息是进行农业结构调整,提升种植管理水平的重要基础信息,对于社会经济发展和粮食安全具有十分重要的意义[1],也是农作物需水量、水资源配置、农田灌溉系统以及水利设施配置等研究的重要背景信息。
闪电河流域试验区是遥感科学国家重点实验室牵头组织的滦河—闪电河联合遥感实验飞行实验区的一部分,在该区域已开展多项大型遥感基础实验,而该地区地表覆盖及农作物分类数据是各项实验重要的基础数据,开展该地区的土地分类尤其是农作物分类研究具有十分重要的意义。该实验区位于我国内蒙古与河北交界,属于我国北方农牧交错地带,土地利用和土地覆盖变化十分复杂,驱动因素较多,准确地获取较高分辨率农作物分类图是研究该区域农作物水分需求和利用的必要条件,同时也是一个研究难题[8]。由于哨兵2号(Sentinel-2)数据具有较高的空间分辨率、独特的“红边”波段、影像可免费获取等显著优点[9],因此使用该数据并结合机器学习的方法进行分类研究是进行闪电河流域农作物分类的一种有效方法。
以内蒙古闪电河流域为研究区,基于欧空局Sentinel-2光学遥感影像,提取相应的光谱特征,纹理特征以及指数特征,利用随机森林和支持向量机算法,采用3种方案:基于像元的分类方法、面向对象的分类方法、改进的基于像元分类与面向对象分割相结合的集成方法,对研究区内的农作物进行精细提取,并利用采集的地面样本进行了分类精度验证。
2 研究区与数据
2.1 研究区概况
闪电河流域实验区位于我国内蒙古与河北交界处,闪电河上游(图1),属于我国北方农牧交错地带,土地利用和土地覆盖变化十分复杂,驱动因素较多。
研究区地处内蒙古高原南缘,属于温带大陆性草原气候,年降水量300~400 mm,约为蒸发量的25%,汛期主要反映在7~9月[10]。研究区主要土地利用类型包括耕地、草地,林地和荒地,主要作物包括:莜麦、土豆、胡萝卜、牧草和玉米等。
2.2 研究数据与预处理
2.2.1 遥感数据
表1 闪电河流域研究区Sentinel2遥感影像信息
Table 1
获取日期 | 获取卫星 | 波段数 | 影像质量 | 作物生长期 |
---|---|---|---|---|
2018-08-01 | S2A | 13 | 无云 | 胡萝卜、土豆:块茎膨大期 莜麦:抽穗期 |
2018-09-05 | S2B | 13 | 无云 | 胡萝卜、土豆:成熟期 莜麦:收获期 |
Sentinel-2数据大气上层表观反射率产品,已经经过几何校正和辐射校正,所以只需要进行大气校正即可[12]。实验中使用SNAP软件中的Sen2cor模型对其进行大气校正,大气校正后将20 m分辨率波段重采样为10 m分辨率。本文采用了波段2、3、4、5、6、7、8、8a、11、12反射率数据。
2.2.2 地面样本数据
表2 闪电河研究区农作物分类样本统计表
Table 2
方案 | 尺度 | 玉米 | 土豆 | 胡萝卜 | 莜麦 | 林地 | 草地 | 建设用地 | 荒地 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
方案一 | 像元 | 9 672 | 34 752 | 19 501 | 11 709 | 22 649 | 8 716 | 10 560 | 3 679 |
25 | 264 | 1 018 | 577 | 432 | 515 | 584 | 1 531 | 285 | |
方案二 | 50 | 100 | 423 | 235 | 175 | 152 | 321 | 400 | 107 |
100 | 46 | 193 | 111 | 86 | 63 | 190 | 153 | 49 |
3 研究方法
3.1 实验方案介绍
共设计3种分类方案进行对比研究,分别是:基于像元的分类方法、面向对象的分类方法、基于像元分类与面向对象分割相结合的集成方法,目的是通过不同方案间的对比,探索闪电河流域农作物提取的最佳分类方案。实验总体流程如图2所示。
图 2
图 2
闪电河流域作物分类实验方案流程图
Fig.2
Flow chart of crop classification experiment scheme in the Shandian river basin
方案一:基于像元的分类。对预处理后的两期Sentinel-2影像提取像元级特征,通过随机森林重要性评估算法获得不同像元级特征的权重并进行特征选择,使用随机森林和支持向量机进行分类,对其进行精度评定及对比分析,得到该方案的最佳分类结果。
方案二:基于对象的分类。依据第一步中提取的像元级特征权重进行多尺度影像分割,提取3种不同尺度的对象级特征;通过随机森林重要性评估算法获得对象级特征的权重并进行特征选择,使用随机森林和支持向量机进行分类,对其进行精度评定及对比分析,得到该方案的最佳分类结果。
方案三:基于像元和对象集成的分类。依据方案一得到的最优像元分类结果和方案二得到的3种尺度的分割结果,进行对象内的像元聚合来确定对象的地物类别,获得3种分类结果,对其进行精度评定及对比分析,得到该方案的最佳分类结果。
最后,对3种方案的分类效果从总体精度、各类别分类精度、目视解译效果、分类性能等方面进行对比分析。
上述3种实验方案共设计了5个子实验(表3),目的是:①对比分析不同方案中,随机森林分类器与SVM分类器的分类性能;②探索不同方案中面向对象分割的最佳尺度;③通过方案之间的对比,探索提升闪电河流域农作物分类效果的最佳方法。
表3 闪电河研究区作物分类实验方案信息
Table 3
方案 | 子实验 | 详细信息 |
---|---|---|
1 | a | 基于像元的随机森林分类 |
b | 基于像元SVM分类 | |
2 | c | 25、50、100分割尺度下基于对象的随机森林分类 |
d | 25、50、100分割尺度下基于对象的SVM分类 | |
3 | e | 依据方案1中优选像元分类结果与方案2中不同尺度分割结果,进行对象内聚合 |
3.2 特征说明
3.2.1 像元特征集
表4 作物分类像元特征集描述
Table 4
特征变量 | 简称 | 说明 |
---|---|---|
光谱特征 | B | B2、B3、B4、B5、B6、B7、B8、B8a、B11、B12 |
指数特征 | NDVI | (B8a-B4)/(B8a+B4) |
NDWI | (B3-B8a)/( B3+B8a) | |
GLCM-A | 角二矩阵 | |
GLCM-cor | 对比度 | |
纹理特征 | GLCM-con | 相关性 |
GLCM-E | 熵 | |
GLCM-dis | 非相似性 | |
GLCM-H | 同质度 |
不同农作物之间物候差异可能比较小,由于本文选用的影像分辨率较高,因此在光谱特征、植被指数、水体指数的基础上,借助纹理信息可显著提高农作物的分类精度[15]。本文选取灰度共生矩阵GLCM(Gray-Level Co-occurrence Matrix)进行纹理分析,其数学表达模型为:
在该式中,#表示在该集合中的元素的数目,f(x1,y1)=I(f(x2,y2)=j)表示图像中(x1,y1)与(x2,y2)位置像元的灰度级为i和j,d表示两个像元之间的距离,
3.2.2 对象特征集
本文使用eCognition软件提供的多尺度影像分割算法(Multiresolution Segmentation)进行影像分割,需要设定波段权重、分割尺度参数、异质性相关因子(color、shape、compactness因子)等参数[18]。将上文提取的像元特征集作为输入数据,通过随机森林算法可获得像元特征集的各特征重要性排序,来确定波段权重;采用目视法,初步设置分割尺度参数为25、50、100;所选异质性相关因子,shape为0.1、0.3、0.5、0.7、0.9,compactness为0.1[19]。得到3种不同尺度的分割对象后,提取对象内部像元特征的均值、标准差、贡献率3种统计特征作为对象特征集[20],共提取104个特征,表5详细描述了各种特征及其表达方式。
表5 作物分类对象特征集描述
Table 5
统计特征 | 简称 | 像素特征类别 | 说明 |
---|---|---|---|
均值 | Mean | 光谱特征 | 求一个对象内所有像素的像素特征的均值 |
植被指数 | |||
水体指数 | |||
纹理特征 | |||
标准差 | Std | 光谱特征 | 求一个对象内所有像元的像元特征的标准差 |
植被指数 | |||
水体指数 | |||
纹理特征 | |||
贡献率 | Ratio | 光谱特征 | 求同一期影像内,一个对象的某一光谱特征平均值与所有光谱特征平均值总和的比率 |
纹理特征 | 求同一期影像内,一个对象的某一纹理特征平均值与所有纹理特征平均值总和的比率 |
3.3 分类算法
在进行基于像元分类和面向对象分类实验的时候,选用了随机森林和支持向量机两种分类器进行分类。
3.3.1 随机森林算法
随机森林方法建立步骤如下:
第一步:在原始样本中,随机抽取N个训练样本(bootstrap方法)放回原始样本,共抽取N个树次,形成N个树训练样本集。
第二步:基于训练样本集,建立n棵CART决策树,形成随机森林。在决策树的生长过程中,每棵树的每个节点随机抽取m个特征(特征总数为M,m≤M)。根据最小基尼系数原理,选择一个分类能力最强的特征来分割决策树中的节点。
第三步:生成多个决策树,构造一个随机森林分类器,并通过投票法决定新样本的类别对数据进行分类。
3.3.2 支持向量机分类算法
支持向量计算法(SVM)是一种基于统计学习的新的机器学习的方法,该算法采用结构风险最小化的原则,在确保误差最小的同时,缩小模型泛化误差的上限,从而提高分类模型的泛化能力[23]。
SVM在解决分类问题时,使用分离超平面作为分离训练数据的线性函数,其求取最优分类面的优化函数如下:
其中:x为分类样本,l为样本个数,y为类别。
针对于非线性分类问题,可以通过某种非线性变换将其转化到高维空间中,在高维特征空间中学习低维空间的分类法则。由于在线性支持向量机学习的对偶问题里,目标函数和分类决策函数都只涉及实例和实例之间的内积,所以不需要显式地指定非线性变换,而是用核函数替换当中的内积。核函数表示,通过一个非线性转换后的两个实例间的内积。具体地,K(x,z)是一个函数,或正定核,意味着存在一个从输入空间到特征空间的映射
在线性支持向量机学习的对偶问题中,用核函数K(x,z)替代内积,求解得到的就是非线性支持向量机如下:
本文使用的核函数为高斯核函数,其形式为:
3.4 基于像元的分类与面向对象分割的集成方法
除传统的基于像元和面向对象的分类方案外,还提出来改进的集成方法,即将基于像元的分类和面向对象的分割相结合[24],以求探索一种分类效果较好且运算量较小的分类方案。
首先,利用随机森林和SVM等分类算法对影像进行基于像元的分类,每个像元都被标记为一个类别;然后,基于多尺度分割方法对影像进行分割,得到的对象均包含一组具有唯一ID(区域标签)的像元。为合并基于像元的分类和面向对象的分割结果,根据以下规则重新分配每个对象内的像元类别:
如果一个对象内部大于阈值A的像素被归为某种地物,则整个对象被分类为该地物。通过统计分割尺度为25的所提取的训练样本中,基于像元进行分类得到的各地类像素所占的百分比,确定本实验阈值为80%。
如果不满足以上条件,则基于像元的分类结果在最终分类结果图中将保持不变,从而在一个对象中产生不同地物类别的像元。
这样可以解决农田异质性和相邻像元间的光谱污染带来的作物像元的缺失,同时可以提升运算效率。
3.5 精度评价
混淆矩阵(Confusion Matrix)主要用于比较分类结果和实际测量值之间的混淆程度进行精度评估[25]。本文对各个方案进行评价时使用的客观评价指标主要包括总体精度、Kappa系数、生产者精度和用户精度。
4 结果与分析
4.1 特征优选分析
图3
像元特征集中得分排名前4的特征为0801-B6、0801-B7、0801-B12、0801-B11,表明红边波段和短波红外波段为最具判别效果的特征,此时马铃薯和胡萝卜正处于块茎膨大期,莜麦处于抽穗期,在此作物生长期提取的光谱特征在判别效果上优于成熟期。纹理特征重要性排名较低,均低于0.01,这表明基于Sentinel-2影像进行作物提取时,加入纹理特征对分类效果提升效果较小,这是由于10 m分辨率在提取不同作物的纹理特征时较为粗糙,提取效果低于高分一号(GF-1)、高分二号(GF-2)、航空影像等高分辨率影像。排名前12个特征的重要性之和为0.69,前24个特征的重要性之和为0.96,因此将前24个特征作为方案一随机森林分类、SVM分类和方案二基于对象的多尺度分割中的输入数据,并按照重要性得分赋予多尺度分割输入特征相应权重(表6)。对象特征集中,排名前35个特征的重要性之和为0.75,前72个特征的重要性之和为95%,因此将前72个特征作为方案二随机森林分类、SVM分类的输入特征,且第28、33、34、35个特征为纹理特征,这表明基于对象的特征提取提升了纹理特征的判别前效果。
表6 对象分割输入特征权重对应表
Table 6
重要性得分 | 0.00~0.02 | 0.02~0.03 | 0.03~0.05 | 0.05~0.07 | 0.07~0.09 |
---|---|---|---|---|---|
特征权重 | 1 | 2 | 4 | 6 | 8 |
4.2 面向对象的分割尺度分析
为得到最优的分类效果,本文所提出的方案二、方案三均需要确定面向对象的最优分割尺度,因此,在使用eCognition软件进行多尺度分割时,通过目视观察,初步确定尺度参数为25、50、100。为更加直观地呈现分割尺度对分类效果的影响,统计不同分割尺度进行分类得到的制图精度和用户精度与各地物类别的关系,得到方案二、方案三各尺度地物分类精度分布图(图4)。考虑到闪电河流域主要作物为土豆、胡萝卜、莜麦,除作物以外的主要地物为草地,在进行确定最优尺度时,将优先考虑这4种地物的分类精度。
图4
图4
不同方案精度统计图
(横坐标A、B、C、D、E、F、G分别表示玉米、土豆、胡萝卜、莜麦、
林地、草地、建设用地、荒地)
Fig.4
Precision statistics of different schemes
由于方案一在进行基于像元的分类时,随机森林有更好的分类效果及分类性能,为简化实验步骤,在确定方案三的最优分割尺度时,只对随机森林的分类结果进行分析。图4(c)表明,应用不同的分割尺度,4种主要地物均有良好的分类效果;在提取树林这一地类时,分割尺度为25的分类效果更好,用户精度远高于其他尺度。因此,方案三的最优尺度为25。
4.3 分类结果分析与精度评价
本文使用3种不同分类方案进行的5个子实验的分类结果如图5和图6所示,通过目视解译可以看出,方案一(图5(a)、5(b)、6(a)、6(b))椒盐噪声较多,种植单一作物的田块内部有很多单个像素被错分为草地或其他作物;有大量低矮稀疏的草原灌木丛被分为林地(如图5(a)中的方框所示)。方案三(图5(e)和方案一(图5(a))相比,田块内部的椒盐噪声大量减少,但更多含灌木的草地被误分为林地((如图5(e)中的方框所示))。对5个子实验中结果差异较大的区域与Sentinel-2原始影像和实地调查数据进行粗略的目视对比,可以看出方案一子实验b(图5(b)、6(b))和方案二(图5(c)、5(d)、6(c)、6(d))的分类效果不理想,存在着明显的错分漏分现象,如:大量草地被误分为林地,大量玉米、莜麦、胡萝卜被错分为其他作物(如图5(b)、5(c)、5(d)中的方框所示)。从目视效果来看,方案一子实验a(图5(a)、6(a))和方案三子实验e(图5(e)、6(e))的制图效果较好。
图5
图5
闪电河流域研究区内不同分类方案局部地区作物分布图(2018年)
Fig.5
Crop distribution map of different classification schemes in the study area of Shandian river basin (2018)
图6
图6
闪电河流域研究区内不同分类方案作物分布图(2018年)
Fig.6
Crop distribution map of different classification schemes in the study area of Shandian river basin (2018)
表7 闪电河流域研究区内作物分类精度统计
Table 7
方案一 | 方案二 | 方案三 | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
类别 | 子实验a | 子实验b | 子实验c | 子实验d | 子实验e | |||||||
PA/% | UA/% | PA/% | UA/% | PA/% | UA/% | PA/% | UA/% | PA/% | UA/% | |||
玉米 | 92.28 | 99.83 | 79.57 | 96.20 | 83.93 | 95.92 | 66.07 | 88.10 | 83.93 | 100 | ||
土豆 | 99.11 | 97.17 | 96.94 | 92.11 | 96.45 | 93.14 | 89.34 | 76.52 | 97.97 | 93.24 | ||
胡萝卜 | 99.22 | 98.65 | 94.11 | 94.78 | 95.90 | 95.12 | 74.59 | 81.25 | 96.72 | 98.33 | ||
莜麦 | 99.58 | 99.53 | 91.26 | 94.46 | 97.98 | 96.04 | 66.67 | 84.62 | 100 | 98.02 | ||
树林 | 99.67 | 95.57 | 97.57 | 86.02 | 93.10 | 93.10 | 86.21 | 74.26 | 98.85 | 86.87 | ||
草地 | 87.08 | 98.00 | 54.57 | 76.33 | 88.33 | 89.08 | 66.67 | 70.18 | 84.17 | 96.19 | ||
居民地 | 99.18 | 99.03 | 97.39 | 97.34 | 99.02 | 98.05 | 100 | 97.76 | 100 | 99.03 | ||
裸土 | 98.43 | 99.60 | 96.99 | 97.63 | 91.07 | 100 | 94.64 | 100 | 98.21 | 100 | ||
总精度% | 97.82 | 91.55 | 95.11 | 84.74 | 96.35 | |||||||
Kappa系数 | 0.974 | 0.897 | 0.941 | 0.815 | 0.957 |
由表7可知,提取像元特征并使用随机森林分类器进行作物提取(方案一子实验a)取得了最优分类精度,总精度为97.8%,Kappa系数为0.97;提取对象特征并使用SVM分类器进行作物提取(方案二子实验d)精度最差,总精度仅为84.8%,Kappa系数为0.82。当对相同的特征使用不同的分类器进行分类时,使用随机森林分类器可取得更高的分类精度:在基于像元的分类中(方案一子实验a),比SVM分类器的分类精度提高6.3%,Kappa系数提高了0.08;在面向对象的分类中(方案二子实验c),其分类精度提升了10.4%,Kappa系数提高了0.13。这说明随机森林分类器更适合进行高维小样本的多类别农作物提取,且运算量远远小于SVM,更适合进行大面积的作物提取。
当使用相同的分类器时,基于像元的方法分类精度均优于面向对象的分类方法。这说明,由于闪电河流域农田田块规整,农业规模经营发展较成熟,在使用Sentinel-2数据进行农作物提取时,像元特征即可具有较好的表达效果;且基于像元进行分类时,可获得更多的训练样本,这对于提升分类器的分类效果具有很重要的作用。
分割尺度为25、使用随机森林作为分类器的方案三子实验e分类精度仅次于使用相同分类器的方案一,高于方案二,总精度为96.4%,Kappa系数为0.96。从单个类别的分类效果来看,方案三在居民地和裸土这两类地物的提取中有最佳分类效果;提取玉米效果最差,制图精度仅为83.9%;除玉米外其他作物的分类效果均接近最佳分类精度。由此可以看出,方案三在提取呈自然分布的细碎地物有优势;在提取农作物时基本效果同方案一相差不大,但受分割尺度和阈值的影响,对于非大规模种植的作物(如玉米),会由于分割尺度较大或阈值较低出现错分;且由于其样本数量较大,分类效果明显优于方案二。
5 结 论
本文基于Sentinel-2数据,采用3种分类方案,结合随机森林和SVM分类器对闪电河流域农作物进行提取,主要得出以下结论:
随机森林分类器相对于SVM分类器,在基于Sentinel-2影像对闪电河流域进行多种农作物提取时,可以发挥更好的分类效果,对比方案一和方案二的各子实验发现,采用随机森林进行分类后,分类精度有大幅改善,并且其分类精度受尺度的影响较小,以上分析说明:随机森林分类器受样本数量影响更小、在样本数量不足的情况下分类精度保持较高水平,且具有模型运算速度快的优点,因此更适用于中高分辨率遥感影像基于小样本的多类作物提取。
对于闪电河流域,部分较为细碎的地物(如草地、林地、荒地、建设用地),地物特征提取受面向对象方法中的分割尺度影响较大;由于该地区种植模式较为成熟,单个地块内作物种类单一且面积较大,因此作物特征提取受分割尺度影响较小,但是随着分割尺度变大,样本对象变少,因此当尺度变大时,作物的分类精度仍迅速降低,以上分析说明,在样本数量不足的情况下,应尽可能使用基于像元方法或面向对象方法小分割尺度进行分类。
对比分析各实验方案,改进的基于像元分类与面向对象分割相结合的集成方法充分结合前两种方案的优点:使用基于像元的方法提取地物特征进行初步分类,保证了训练样本的数量,缩短了模型运行时间;面向对象分割后进行像素聚合,可有效减少基于像元分类的椒盐噪声,提升田块边缘的分类效果。以上分析说明,该集成方法可有效提升闪电河流域的作物分类效果。
本研究的主要优势在于对新数据源Sentinel-2数据的引入以及不同特征提取方法、分类方案的评价分析,并且本文也验证了新的集成分类方案的可行性。同时,本文对闪电河流域的作物分布研究也可为该地区遥感综合实验提供宝贵的基础数据。但在后续研究中仍需在以下方面进行改进:①对于作物分类,样本的数量和质量是制约分类精度的重要因素,本次实验中由于样本数量不足影响了面向对象方法的分类精度,未来应通过进一步地面调查,扩大地面样本采集范围,为样本库扩容。②在特征选取方面,不同的特征组合对各作物的提取效果有很大影响,这方面缺乏深入的研究。③受数据质量(包括云覆盖)的影响,Sentinel-2数据可选取的时相较少,未充分利用时相特征对作物进行分类,后续的工作重点将主要研究如何利用多源数据的多时相信息进行闪电河流域的农作物分类。
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